полный текст метода:

&НаКлиенте
Процедура ОбработкаПодтвержденияОПерезаписиДокумента(Ответ, ДопПараметры) ЭКСПОРТ
	
	Если НЕ ИзДокумента Тогда
		Если Ответ = КодВозвратаДиалога.Да Тогда
			ЗаполнитьОбъектНаКлиенте(Неопределено);
		КонецЕсли;
	
	Иначе
		
		ОбъектыНазначенияМассив = Параметры.ОбъектыНазначения.ВыгрузитьЗначения();
		
		Если Ответ = КодВозвратаДиалога.Да Тогда
			
			//Если пользователь дал разрешение на продолжение, то начнем перебирать все
			//документы, у которых мы планируем заполнить табличную часть
			Для каждого Элемент из ОбъектыНазначенияМассив Цикл
				
				//Зададим ключ поиска документа, из которого вызвана данная обработка,
				//чтобы получить ссылку на редактирумый документ в удобном виде для
				//функции ОткрытьФорму()
				КлючПоиска = Новый Структура("Ключ", Элемент);
				
				//Но нам не надо открывать новую форму (окно) для изменяемого документа, а
				//Нам надо все изменения показать в уже открытых у клиента окнах
				Окна = ПолучитьОкна();
				Для каждого Окно из Окна Цикл
					
					//Окно изменяемого документа будет точно не основным, а вспомогательным, поэтому
					//сразу пропускаем основное окно, а далее идем на не очень хороший способ поиска открытого окна
					//изменяемого документа. Мы просто переберем все окна, а в заголовке, которых будет встречаться
					//Наименование, номер и дата нужного документа - будем изменять
					Если НЕ Окно.Основное И Найти(Окно.Заголовок, Элемент) Тогда
						//Передадим ключ поиска (можно сказать ссылку на объект) и данные о найденном открытом окне
						//в функцию ОткрытьФорму()
						//Код находится в цикле на тот случай, если открытых окон изменяемого документа больше одного
						ФормаДок = ОткрытьФорму("Документ.ЗаказКлиента.Форма.ФормаДокумента",КлючПоиска,,,Окно);
						
						//Далее мы получаем объект только, что повторно открытой формы и помещаем её в переменную
						//В объекте содержатся все реквизиты (элементы) формы
						ДокО = ФормаДок.Объект;
						//Сообщить("ТИП ОБЪЕКТА: "+ТипЗнч(ДокО));
						
						//Мы помещаем объект формы в переменную,
						//так как должны передать её в процедуру на сервере,
						//где нельзя изменять объект формы, зато можно править переменную содержащую его
						ЗаполнитьОбъектНаКлиенте(ДокО);
						
						//После выполнения процедуры на сервере мы получаем изменную переменную НовыйОбъект,
						//которую необходимо передать в уже полученную нами форму
						КопироватьДанныеФормы(ДокО, ФормаДок.Объект);
						//ЭтаФорма.Закрыть();
						
						//Сообщить("ОБНОВЛЯЮ ФОРМУ ДОКУМЕНТА");
						ФормаДок.ОбновитьОтображениеДанных();
						ФормаДок.Прочитать();
						
						//ФормаДок.Элементы.Товары.Обновить();
						
					КонецЕсли;
				КонецЦикла;
				
			КонецЦикла;
		КонецЕсли;
		
	КонецЕсли;
	
КонецПроцедуры

Только непонятно, почему в момент вызова ЗаполнитьОбъектНаКлиенте() (а в нем - вызов сервера и заполнение на сервере) закрывается текущая форма обработки, контекст передается в форму документа, оно заполняется в фоне, а потом только обновляет форму документа.